El programa de Maestría es un posgrado que busca brindar conocimiento de vanguardia en la Fisiología del Ejercicio, para permitir a los profesionistas de las ciencias del movimiento humano aplicar (por medio del autoempleo) programas de ejercicio físico grupales o individuales con enfoque de fortalecimiento del fitness y del desempeño físico (instructor personal) en los habitantes de Baja California que cuentan con un buen estado de salud, pero que desean mejorar su condición física. Es importante mencionar que actualmente, ninguna de las 119 instituciones de educación superior presentes en el estado de Baja California ofrece una Maestría en Fisiología del Ejercicio (con orientación de investigación o profesional).